Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms