Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfc3h1B2RT41 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfc3h1B2RT41 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfc3h1B2RT41 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfc3h1B2RT41 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfc3h1B2RT41 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfc3h1B2RT41 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfc3h1B2RT41 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms