Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brpf3B2KF05 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms