Protein–RNA interactions for Protein: B1AUC4

Ube2u, Ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2uB1AUC4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ube2uB1AUC4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ube2uB1AUC4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms