Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms