Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprsB0V2N1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprsB0V2N1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtprsB0V2N1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtprsB0V2N1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprsB0V2N1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprsB0V2N1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprsB0V2N1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprsB0V2N1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprsB0V2N1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprsB0V2N1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprsB0V2N1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms