Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Supt3B0QZW4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Supt3B0QZW4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Supt3B0QZW4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Supt3B0QZW4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Supt3B0QZW4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Supt3B0QZW4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Supt3B0QZW4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Supt3B0QZW4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Supt3B0QZW4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Supt3B0QZW4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Supt3B0QZW4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Supt3B0QZW4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Supt3B0QZW4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Supt3B0QZW4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Supt3B0QZW4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Supt3B0QZW4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Supt3B0QZW4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Supt3B0QZW4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Supt3B0QZW4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Supt3B0QZW4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Supt3B0QZW4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Supt3B0QZW4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Supt3B0QZW4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Supt3B0QZW4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Supt3B0QZW4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms