Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms