Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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