Protein–RNA interactions for Protein: A2ATJ4

Olfr1200, Olfactory receptor, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Olfr1200A2ATJ4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Olfr1200A2ATJ4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Olfr1200A2ATJ4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms