Protein–RNA interactions for Protein: A2APU8

Fam205a, Protein FAM205A, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam205aA2APU8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam205aA2APU8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam205aA2APU8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam205aA2APU8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam205aA2APU8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam205aA2APU8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam205aA2APU8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms