Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms