Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GabreA2AMW3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms