Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r2A2AMT6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r2A2AMT6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms