Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan16A2ALW2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms