Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ambra1A2AH22 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms