Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms