Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itgb4A2A863 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms