Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms