Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71e1A1L3C1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms