Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YCZ6

1700016G14Rik, RIKEN cDNA 1700016G14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016G14RikA0A286YCZ6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016G14RikA0A286YCZ6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016G14RikA0A286YCZ6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016G14RikA0A286YCZ6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016G14RikA0A286YCZ6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016G14RikA0A286YCZ6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700016G14RikA0A286YCZ6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
1700016G14RikA0A286YCZ6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
1700016G14RikA0A286YCZ6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700016G14RikA0A286YCZ6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms