Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIW3

Frmpd3, FERM and PDZ domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd3A0A140LIW3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd3A0A140LIW3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms