Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv21A0A0A6YX06 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms