Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 4930470P17Rik-201ENSMUST00000062355 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16551-203ENSMUST00000160979 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14164-202ENSMUST00000128577 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Fam32a-201ENSMUST00000003123 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Bdh2-202ENSMUST00000120397 1172 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11520-201ENSMUST00000122837 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15416-201ENSMUST00000131080 442 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12977-201ENSMUST00000133742 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Anp32e-207ENSMUST00000170125 413 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29471-201ENSMUST00000190527 700 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36973-201ENSMUST00000193942 259 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30835-201ENSMUST00000198825 689 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Fcer2a-207ENSMUST00000208492 1053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18780-201ENSMUST00000209594 574 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl19-ps2-201ENSMUST00000219540 590 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 AC122821.1-201ENSMUST00000228934 705 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Kng2-201ENSMUST00000039338 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28905-202ENSMUST00000219328 1377 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Klf8-201ENSMUST00000039545 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Rsph14-203ENSMUST00000159994 1728 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms