Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a4Q9Z306 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms