Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms