Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hdac6Q9Z2V5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac6Q9Z2V5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac6Q9Z2V5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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