Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HnrnpcQ9Z204 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HnrnpcQ9Z204 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms