Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms