Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
D17h6s53eQ9Z1R4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms