Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms