Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms