Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms