Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nup160Q9Z0W3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms