Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R4

Itsn1, Intersectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn1Q9Z0R4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itsn1Q9Z0R4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itsn1Q9Z0R4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itsn1Q9Z0R4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itsn1Q9Z0R4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itsn1Q9Z0R4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itsn1Q9Z0R4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itsn1Q9Z0R4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Itsn1Q9Z0R4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Itsn1Q9Z0R4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms