Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV92

Epb41l3, Band 4.1-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l3Q9WV92 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l3Q9WV92 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epb41l3Q9WV92 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epb41l3Q9WV92 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms