Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapaQ9WV55 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapaQ9WV55 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms