Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms