Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd6ipQ9WU78 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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