Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AtrnQ9WU60 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AtrnQ9WU60 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
AtrnQ9WU60 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
AtrnQ9WU60 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AtrnQ9WU60 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AtrnQ9WU60 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AtrnQ9WU60 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AtrnQ9WU60 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AtrnQ9WU60 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AtrnQ9WU60 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AtrnQ9WU60 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AtrnQ9WU60 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AtrnQ9WU60 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AtrnQ9WU60 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AtrnQ9WU60 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms