Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Usp18Q9WTV6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Usp18Q9WTV6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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