Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam50bQ9WTJ8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms