Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Plod1Q9R0E2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms