Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Lamc3Q9R0B6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Lamc3Q9R0B6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Lamc3Q9R0B6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Lamc3Q9R0B6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Lamc3Q9R0B6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
Lamc3Q9R0B6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
Lamc3Q9R0B6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lamc3Q9R0B6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lamc3Q9R0B6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lamc3Q9R0B6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lamc3Q9R0B6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lamc3Q9R0B6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Lamc3Q9R0B6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lamc3Q9R0B6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Lamc3Q9R0B6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Lamc3Q9R0B6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Lamc3Q9R0B6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Lamc3Q9R0B6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Lamc3Q9R0B6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms