Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AmfrQ9R049 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms