Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clic4Q9QYB1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Clic4Q9QYB1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Clic4Q9QYB1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Clic4Q9QYB1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Clic4Q9QYB1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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Clic4Q9QYB1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clic4Q9QYB1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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