Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms