Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms