Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms