Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad18Q9QXK2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms